Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTF1AQ7RTS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTF1AQ7RTS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PTF1AQ7RTS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTF1AQ7RTS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTF1AQ7RTS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTF1AQ7RTS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms