Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF7Q6Q0C0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF7Q6Q0C0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF7Q6Q0C0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAF7Q6Q0C0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAF7Q6Q0C0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF7Q6Q0C0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms