Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 TRR2YHR106W 1029 nt9.01□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 ZIM17YNL310C 525 nt9.01□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 AAD14YNL331C 1131 nt9.01□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 CST26YBR042C 1194 nt9.01□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 INO1YJL153C 1602 nt9.01□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 AGP3YFL055W 1677 nt9□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 WSC3YOL105C 1671 nt9□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 CDC3YLR314C 1563 nt9□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 MBF1YOR298C-A 456 nt9□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 LGE1YPL055C 999 nt9□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 RRP43YCR035C 1185 nt8.99□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 PSA1YDL055C 1086 nt8.98□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 MTO1YGL236C 2010 nt8.98□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 DIP5YPL265W 1827 nt8.98□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 NDE2YDL085W 1638 nt8.98□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 STE3YKL178C 1413 nt8.97□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 PRS4YBL068W 981 nt8.97□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 OSM1YJR051W 1506 nt8.96□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 BUD31YCR063W 474 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 CPR2YHR057C 618 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 POR2YIL114C 846 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 HRB1YNL004W 1365 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 HXK1YFR053C 1458 nt8.96□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 YNL295WYNL295W 1575 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 TOK1YJL093C 2076 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 PLB3YOL011W 2061 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 SNP1YIL061C 903 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 YDR306CYDR306C 1437 nt8.95□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 GAL2YLR081W 1725 nt8.94□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 DTR1YBR180W 1719 nt8.94□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 ARO3YDR035W 1113 nt8.93□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 RSC4YKR008W 1878 nt8.92□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 ALD5YER073W 1563 nt8.92□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 INP54YOL065C 1155 nt8.92□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 YER152CYER152C 1332 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 ALG7YBR243C 1347 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 DST1YGL043W 930 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 TDA4YJR116W 840 nt8.91□□□□□ -0.98
SYF1Q04048 SPS1YDR523C 1473 nt8.89□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 MRP7YNL005C 1116 nt8.89□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 PRY2YKR013W 990 nt8.88□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 HIS3YOR202W 663 nt8.88□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 PSD1YNL169C 1503 nt8.87□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 MPH3YJR160C 1809 nt8.87□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 TGL5YOR081C 2250 nt8.86□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 BIO3YNR058W 1443 nt8.86□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 GAL83YER027C 1254 nt8.85□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 YPT10YBR264C 600 nt8.85□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 TRP2YER090W 1524 nt8.85□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 THI6YPL214C 1623 nt8.84□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 CYT1YOR065W 930 nt8.84□□□□□ -0.99
SYF1Q04048 GLY1YEL046C 1164 nt8.83□□□□□ -1
SYF1Q04048 PIL1YGR086C 1020 nt8.83□□□□□ -1
SYF1Q04048 YML122CYML122C 381 nt8.83□□□□□ -1
SYF1Q04048 YLR072WYLR072W 2082 nt8.83□□□□□ -1
SYF1Q04048 PPZ2YDR436W 2133 nt8.83□□□□□ -1
SYF1Q04048 TIF3YPR163C 1311 nt8.82□□□□□ -1
SYF1Q04048 WSC4YHL028W 1818 nt8.82□□□□□ -1
SYF1Q04048 SKP1YDR328C 585 nt8.82□□□□□ -1
SYF1Q04048 DSC3YOR223W 879 nt8.82□□□□□ -1
SYF1Q04048 ABP1YCR088W 1779 nt8.81□□□□□ -1
SYF1Q04048 SML1YML058W 315 nt8.81□□□□□ -1
SYF1Q04048 PDA1YER178W 1263 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 INM1YHR046C 888 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 YJR154WYJR154W 1041 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 LDB7YBL006C 543 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 LEA1YPL213W 717 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 NFS1YCL017C 1494 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 CYS4YGR155W 1524 nt8.8□□□□□ -1
SYF1Q04048 MTC6YHR151C 1581 nt8.79□□□□□ -1
SYF1Q04048 PMP3YDR276C 168 nt8.79□□□□□ -1
SYF1Q04048 PUS7YOR243C 2031 nt8.78□□□□□ -1
SYF1Q04048 GET2YER083C 858 nt8.78□□□□□ -1
SYF1Q04048 DML1YMR211W 1428 nt8.78□□□□□ -1
SYF1Q04048 YLR162WYLR162W 357 nt8.77□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 AOS1YPR180W 1044 nt8.77□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 snR30snR30 606 nt8.77□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 YRF1-2YER190W 5046 nt8.77□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 MRN1YPL184C 1839 nt8.77□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 HAM1YJR069C 594 nt8.76□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 YNL140CYNL140C 570 nt8.76□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 DCR2YLR361C 1737 nt8.75□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 PAM17YKR065C 594 nt8.75□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 ERG10YPL028W 1197 nt8.75□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 YLR184WYLR184W 348 nt8.73□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 DPM1YPR183W 804 nt8.73□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 NAF1YNL124W 1479 nt8.72□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 HXT11YOL156W 1704 nt8.72□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 ELP6YMR312W 822 nt8.72□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 FET5YFL041W 1869 nt8.72□□□□□ -1.01
SYF1Q04048 FCY22YER060W-A 1593 nt8.71□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YHR033WYHR033W 1272 nt8.71□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 SUN4YNL066W 1263 nt8.71□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YMR074CYMR074C 438 nt8.7□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YPC1YBR183W 951 nt8.7□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 MDL2YPL270W 2322 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 DAL80YKR034W 810 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 YPR130CYPR130C 408 nt8.68□□□□□ -1.02
SYF1Q04048 KTR4YBR199W 1395 nt8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.5 ms