Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CRB1P82279 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CRB1P82279 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CRB1P82279 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CRB1P82279 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CRB1P82279 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CRB1P82279 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CRB1P82279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CRB1P82279 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CRB1P82279 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CRB1P82279 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CRB1P82279 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CRB1P82279 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CRB1P82279 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CRB1P82279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CRB1P82279 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CRB1P82279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CRB1P82279 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CRB1P82279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CRB1P82279 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CRB1P82279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CRB1P82279 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CRB1P82279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CRB1P82279 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CRB1P82279 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CRB1P82279 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CRB1P82279 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CRB1P82279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CRB1P82279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CRB1P82279 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CRB1P82279 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CRB1P82279 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CRB1P82279 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CRB1P82279 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CRB1P82279 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CRB1P82279 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CRB1P82279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CRB1P82279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CRB1P82279 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CRB1P82279 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CRB1P82279 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CRB1P82279 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CRB1P82279 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CRB1P82279 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CRB1P82279 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CRB1P82279 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CRB1P82279 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CRB1P82279 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CRB1P82279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CRB1P82279 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CRB1P82279 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CRB1P82279 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CRB1P82279 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CRB1P82279 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CRB1P82279 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CRB1P82279 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CRB1P82279 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CRB1P82279 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CRB1P82279 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CRB1P82279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CRB1P82279 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CRB1P82279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CRB1P82279 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CRB1P82279 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CRB1P82279 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CRB1P82279 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CRB1P82279 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CRB1P82279 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CRB1P82279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CRB1P82279 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CRB1P82279 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CRB1P82279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CRB1P82279 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CRB1P82279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CRB1P82279 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CRB1P82279 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CRB1P82279 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CRB1P82279 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CRB1P82279 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CRB1P82279 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CRB1P82279 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CRB1P82279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRB1P82279 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRB1P82279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRB1P82279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRB1P82279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRB1P82279 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRB1P82279 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CRB1P82279 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CRB1P82279 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CRB1P82279 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CRB1P82279 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms