Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL6P80162 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL6P80162 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL6P80162 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL6P80162 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms