Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NLRP6P59044 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NLRP6P59044 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NLRP6P59044 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NLRP6P59044 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NLRP6P59044 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP6P59044 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms