Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB2P49721 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB2P49721 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB2P49721 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms