Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPL13AP40429 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL13AP40429 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL13AP40429 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms