Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clec11aO88200 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clec11aO88200 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Clec11aO88200 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clec11aO88200 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clec11aO88200 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec11aO88200 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms