Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RFPL2O75678 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFPL2O75678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RFPL2O75678 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFPL2O75678 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL2O75678 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms