Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem200bD3Z0P8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem200bD3Z0P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem200bD3Z0P8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms