Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC01549A6NIU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01549A6NIU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01549A6NIU2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms