Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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