Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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USP53Q70EK8 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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