Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHHQ15465 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHHQ15465 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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