Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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ODF1Q14990 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ODF1Q14990 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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