Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FHL3Q13643 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms