Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAMK2BQ13554 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms