Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms