Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HOXD10P28358 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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