Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
RNF39Q9H2S5 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms