Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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