Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
FAM43BQ6ZT52 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FAM43BQ6ZT52 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms