Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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NKX1-1Q15270 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NKX1-1Q15270 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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