Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SPIDRQ14159 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SPIDRQ14159 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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