Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRPF3Q9ULD4 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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