Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01761-201ENST00000424943 2755 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA10-202ENST00000612503 4462 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SECISBP2-209ENST00000534113 3584 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD2BP2-201ENST00000305596 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133367.1-201ENST00000568177 4063 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA8-201ENST00000269080 5677 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP150-201ENST00000362969 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNT3-209ENST00000397304 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL683807.1-201ENST00000427886 445 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPSAP64-201ENST00000451820 336 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL120P-201ENST00000463924 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107421.1-201ENST00000477300 404 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL316P-201ENST00000483452 272 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1-5-201ENST00000496168 532 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR200CHG-201ENST00000537269 350 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018554.3-201ENST00000614215 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7850-201ENST00000618087 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL650P-201ENST00000619902 299 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512638.3-201ENST00000620370 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO2B1-201ENST00000289575 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF548-202ENST00000366197 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCD4-203ENST00000432688 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDHL-201ENST00000374103 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CSF2RB-201ENST00000262825 4087 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NEFM-203ENST00000437366 3148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093642.2-201ENST00000625132 4805 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC2-202ENST00000368972 3663 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HHAT-207ENST00000541565 3164 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TCN2-205ENST00000450638 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms