Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms