Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CRY1Q16526 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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