Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TAF13Q15543 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms