Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
ALCAMQ13740 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ALCAMQ13740 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms