Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA2O43364 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms