Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NTRK3-208ENST00000557856 2622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF185-211ENST00000535861 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SOCS4-204ENST00000555846 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SAMD8-204ENST00000542569 6782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 OTUB2-201ENST00000203664 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC124804.1-202ENST00000583712 4315 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM213-203ENST00000442682 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 BOC-201ENST00000273395 4276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MROH8-203ENST00000400441 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SH3TC2-215ENST00000515425 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DEPDC5-201ENST00000382111 5212 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms