Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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