Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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