Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CLDN25C9JDP6 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms