Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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