Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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RAB39AQ14964 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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RAB39AQ14964 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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RAB39AQ14964 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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RAB39AQ14964 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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RAB39AQ14964 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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RAB39AQ14964 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RAB39AQ14964 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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