Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms