Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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SHROOM2Q13796 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SHROOM2Q13796 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHROOM2Q13796 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
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SHROOM2Q13796 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SHROOM2Q13796 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SHROOM2Q13796 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SHROOM2Q13796 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHROOM2Q13796 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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