Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms