Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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