Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GGA3Q9NZ52 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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