Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF263-201ENST00000219069 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-209ENST00000449285 4328 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G4C-219ENST00000599111 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PARM1-201ENST00000307428 5011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF772-201ENST00000343280 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAM1-207ENST00000636887 4160 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RTEL1P1-201ENST00000504490 3685 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF827-208ENST00000513320 3165 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA71A-201ENST00000364729 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Z97987.1-202ENST00000411708 391 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G6-204ENST00000417303 501 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012363.2-201ENST00000437837 555 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365356.2-201ENST00000441526 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008267.4-201ENST00000442005 521 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL36P4-201ENST00000456725 318 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL687P-201ENST00000480496 285 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL159P-201ENST00000485164 292 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL344P-201ENST00000485522 296 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP522-201ENST00000516144 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP521-201ENST00000516203 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139300.2-201ENST00000556332 553 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4EBP1P1-201ENST00000557776 341 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012313.7-201ENST00000598051 409 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.23-201ENST00000614169 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.155-201ENST00000616367 282 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6124-201ENST00000617177 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RFPL3-AS1_1.2-201ENST00000618747 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135068.9-201ENST00000628927 355 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4A-204ENST00000368285 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL2-201ENST00000356766 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf132-203ENST00000555004 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF182-204ENST00000488300 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DSG4-202ENST00000359747 4526 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF5A-202ENST00000455537 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CATSPERG-204ENST00000410018 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TUT1-205ENST00000476907 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD4-201ENST00000011653 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4D-211ENST00000438547 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO2A-201ENST00000343933 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms