Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP21-2Q3LI59 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms