Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms