Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPAQ15257 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms