Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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