Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms