Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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